El Palacio de Cristal fue levantado en 1887 con motivo de la Exposición de las Islas Filipinas, celebrada ese mismo año, así como el estanque que tiene a sus pies. Dicha exposición fue una más dentro de esa proliferación de exposiciones universales a lo largo del siglo XIX, y con ella se pretendía mantener unos lazos de conocimiento y comunicación de España con las provincias ultramarinas.
El Pabellón es uno de los más característicos ejemplos de Arquitectura del Hierro y Cristal y fue concebido por Velázquez Bosco con vocación de permanencia para que, una vez finalizada la exposición en la que debían exhibirse flores y plantas exóticas, se utilizara como un hipotético museo ultramarino.